1樓：侑藥
夏農bai-維納多
樣性指數 shannonwiener's diversity index h=-∑dupilnpi，其中
zhipi是第i種在總體中的個dao體比例。
2.辛普森版多樣性指數 simpson's diversity index d=1-∑(ni(ni-1))/(n(n-1))，其中ni為群落中權第i種的個體數，n為群落中所有種的個體數。
3. gleason（1922）指數 d=s/lna 式中a為單位面積，s為群落中的物種數目
4. b. margalef（1951，1957，1958）指數 d=（s-1）/lnn 式中s為群落中的總數目，n為觀察到的個體總數。
5.種間相遇機率（pie）指數 d=n（n-1）/∑ni（ni-1） 式中ni為種i的個體數，n為所在群落的所有物種的個體數之和。
6. pielou均勻度指數 e=h/hmax 式中h為實際觀察的物種多樣性指數，hmax為最大的物種多樣性指數，hmax=lns（s為群落中的總物種數）
哪位大神會用r軟體計算微生物多樣性指數
2樓：芒果味鮮奶
(2)gini多樣性
指數d1=1-∑（baipi×pi）；du (3)shannon-wiener多樣性指數zhihp=-∑(pi×lnpi)； (4)simpson多樣性指數d=1-∑ni(ni-1)/〔
daon(n-1)〕； (5)生態回優勢度c=ni(ni-1)/〔n(n-1)〕； (6)pielou均勻
答度指數jsw=-∑(pilnpi)/lns.式中s為樣方中觀察的物種數。
3樓：匿名使用者
資料格式
plotname species abundance
plot1 sp1 3
plot1 sp2 6
plot1 sp3 1
plot1 sp4 2
plot1 sp5 1
plot2 sp1 8
plot2 sp3 30
***<- read.csv("*:/**/**.csv", header=t)
資料換library(spaa)
**<- data2mat(***)
匯入vegan，r中多樣性計算是在vegan包中進行的
library(vegan)
#計算shannon-wiener指數
shannon.wiener <- diversity(herb.mat, index = "shannon")
#計算simpson指數
simpson <- diversity(herb.mat, index = "simpson")
#計算inverse simpson指數
inverse.simpson <- diversity(herb.mat, index = "inv")
#計算物種累計數
s <- specnumber(herb.mat)
plot(s)
#計算pielou均勻度指數
j <- shannon.wiener/log(s)
說知道：物種多樣性，群落優勢度指數，物種豐富度這些指標怎麼算啊
4樓：angela韓雪倩
物種多樣性計算公式：
(1)豐富度指數 r=s；
(2)gini多樣性指數d1=1-∑（pi×pi）；
(3)shannon-wiener多樣性指數hp=-∑(pi×lnpi)；
(4)simpson多樣性指數d=1-∑ni(ni-1)/〔n(n-1)〕；
(5)生態優勢度c=ni(ni-1)/〔n(n-1)〕；
(6)pielou均勻度指數jsw=-∑(pilnpi)/lns，式中s為樣方中觀察的物種數；pi=ni/n，n為樣方中各物種多度指標總和，ni為第i個種的多度指標。
物種豐富度和均勻度的函式，是用來描述一個群落的多樣性的統計量。物種多樣性指數分析在比較不同群落的物種多樣性時，可依照研究者的不同需要採用不同指數。物種多樣性指數是分析群落物種多樣性特徵的簡單方法。
多樣性分析方法的選取
5樓：中地數媒
物種多樣性是指群落中物種數目的多少，它是衡量群落規模和重要性的基礎，可表示生物群落結構的內涵，可用來反映環境變化對生物的影響以及水環境質量的高低。種類 越 多，各 個 種 個 體 數 量 分 布 越 均 勻，物 種 多 樣 性 指 數 越 大 (劉 錄 三，2002 ) 。
在 20 世紀的前幾十年間，已經提出了大量的物種多樣性指數，這些指數按性質可劃分為四類: 物種豐富度指數、物種多樣性指數、均勻度指數及生態優勢度指數。
物種豐富度用以表明種類多樣性的豐富與貧乏狀況，最簡單最古老的物種多樣性測度方法是考慮物種數目而不考慮種間個體數量的差異。現在常用的物種豐富度指數有 patrick(s) 指數、margalef 指數、gleason 指數 (馬克平，2001; 魏玉蓮，1994) 。
物種多樣性指數是對物種豐富度與均勻度的綜合，表示各種類的相對丰度，反映群落物種多樣性，能較好地反映群落物種豐富度。其中常用的有 shannon-wiener 指數、gini 指數、brilloum 指數等。優勢度指數是反映各種群優勢狀況的指標，是群落結構及多樣性的一個度量值，以表徵群落的組成結構特徵，是對多樣性的反面，即集中性的度量。
現在被明確作為優勢度指數的只有 simpson 指數 (郭玉清，2000) 。
由於物種多樣性指數是把物種豐富度與均勻度綜合起來的一個統計量，因此均勻度是群落多樣性研究中一個很重要的概念。均勻度指數表示群落中不同物種分佈的均勻程度，現在常用的均勻度指數有: aleotalo 均勻度指數、pitlou 均勻度指數、hurlbort 均勻度指數(馬克平，1994) 。
大量的物種多樣性指數被提出，根據多數學者的分析結果，patrick 指數 (s) ，shan-non-wiener 指數 (h') 和 simpson 指數 (d) 、margalef 指數 (d) 、pielou 均勻度指數 (j)最為常用。根據具體情況，研究所選用的指數計算方法如下所示:
(1) shannon-wiever 多樣性指數 (diversity index) (shannnon c e，et al.) :
煤礦塌陷塘環境生態學研究
式中:h'為shannon-wiener多樣性指數;s為樣品中生物的種類總數;pi為第i種的個體數(ni)或生物量(wi)與總個體數(n)或總生物量(w)的比值(ni/n或wi/w)。
由於浮游動物個體較少且相對比較均勻，所以一般都用個體數來計算。
(2)優勢集中性指數(simpsoneh，1949):
煤礦塌陷塘環境生態學研究
式中:c為優勢集中性指數;ni為樣品中第i種生物的個體數;n為樣品中生物總個體數。
(3)物種豐富度指數(species richness index，margalef，1958):
煤礦塌陷塘環境生態學研究
式中:d為margalef多樣性指數;s為樣品中生物種類數;n為樣品中個體總數。
(4)均勻度指數(pielou』s evenness)(pielouec，1975):
煤礦塌陷塘環境生態學研究
式中:j為均勻度指數;h'為式(4.1)中shannon-wiener種類多樣性指數值;hmax為logs
2，表示多樣性指數的最大值，s為樣品中總種類數。
均勻度指數是2023年pielou提出的，用於衡量群落中各種個體數的差異程度。j值範圍為0～1之間，j大時，體現種間個體數分佈較均勻，反之，j值小反映種間個體數分佈欠均勻。一般，水體中的浮游動物分佈越均勻指數值就越大。
豐富度指數、多樣性指數、均勻度、物種優勢度分別是什麼含義？有什麼評價標準嘛？具體一些 20
6樓：匿名使用者
多樣性指數通常用於判斷
群落或生態系統的穩定性指標，
（1）shannon-wiener指數基於物種數量反映群落種類多樣性：群落中生物種類增多代表了群落的複雜程度增高，即h′值愈大，群落所含的資訊量愈大。
h′= -∑[（ni/n）ln(ni/n)]
（2）margalef指數反映群落物種豐富度：指一個群落或環境中物種數目的多寡，亦表示生物群聚（或樣品）中種類豐富度程度的指數。
d′=(s-1)/lnn
（3）simpson優勢度指數：當 值越大，表示優勢度物種越小，亦表示奇異度越高。
（4）pielou指數反映群落均勻度：利用各海域站點的物種奇異度 (h')，估計該群落物種分佈的均勻度。
生態學中優勢指數時怎麼計算的？ 10
7樓：我是熊嶽人
重要值（sdr4）=（相對密度+相對蓋度+相對頻度+相對高度）/4×100 %。
（1）shannon-wiener多樣性指數（h′） h′= -∑pi㏑pi
（2）simpon多樣性指數（d） d=1-∑（pi）2
（3）pielou均勻度指數（jp） jp= -（∑pi㏑pi）/㏑s
（4）alatalo均勻度指數（ea） ea=[（∑pi2）-1 -1]/[exp（-∑pi㏑pi）-1]
（5）margalef豐富度指數（ma） ma=（s-1）/lnn
（6）patrick豐富度指數（pa） pa=s
式中：s—所在群落的物種數目；n—所在群落的所有物種的個體數之和；ni—所在群落內物種i的個體數；pi=ni/n。
8樓：☆angel兔兔
：①種類數目，即豐富度；②種類中個體分配上的平均性（equitability）或均勻性（evenness）。種類數目多，可增加多樣性；同樣，種類之間個體分配的均勻性增加也會使多樣性提高。
物種多樣化，豐富度，辛普森指數有何區別？有何聯絡
9樓：三頭長頸鹿雷劈
物種多樣性計算公式
（1）豐富度指數 r=s；
(2)gini多樣性指數d1=1-∑（pi×pi）；
(3)shannon-wiener多樣性指數hp=-∑(pi×lnpi)；
(4)simpson多樣性指數d=1-∑ni(ni-1)/〔n(n-1)〕；
(5)生態優勢度c=ni(ni-1)/〔n(n-1)〕；
(6)pielou均勻度指數jsw=-∑(pilnpi)/lns.式中s為樣方中觀察的物種數；pi=ni/n，n為樣方中各物種多度指標總和，ni為第i個種的多度指標.
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1 設立新變數名r c w 2 錄入下表 變數名不用錄入，直接錄入相應變數值。注意行列相對應！r c w 1 1 9 1 2 11 1 3 161 1 4 80 1 5 34 2 1 4 2 2 17 2 3 126 2 4 63 2 5 81 3 1 11 3 2 21 3 3 172 3 4 7...
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