如何查詢基因參與的代謝通路,如何查詢一個基因參與的代謝通路

2021-04-20 01:14:26 字數 1210 閱讀 7598

1樓:月神

一般現在的

復科技服制務公司如果做了kegg pathway資料庫bai註釋的話,都會做代du

謝通路圖的註釋,可以從zhi結果檔案中的代dao謝通路圖查詢,找到想要的代謝通路圖後,再分析哪些基因在基因組上存在。

謝通路是kegg資料庫裡的pathway資料庫。可以通過全基因組**了編碼基因後,進行pathway資料庫註釋,從註釋結果的功能資訊中通過關鍵字查詢。一般都能找到。

如果找不到,有可能是關鍵字不對或者基因組中沒有這樣的代謝通路功能基因。

2樓:shine雪瑞

代謝通路:目前在通路資料庫(pathway database) 中代謝通路是建立得最好的,有大約專90個參考代謝途徑的圖形。每屬個參考代謝途徑是一個由酶或ec號組成的網路。

利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有 的代謝通路:

先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的基因。

然後合理地安排ec號。

最後將基因組中的基因和參照通路中用ec號編號的基因產物 結合起來。

已經做完細菌的全基因組測序,怎麼能夠找到我要的某個基因的代謝路徑呢? 50

3樓:匿名使用者

代謝通路是kegg資料庫裡的pathway資料庫。可以通過全基因組**了編碼基因後,進行pathway資料庫註釋,從註釋結果的功能資訊中通過關鍵字查詢。一般都能找到。

如果找不到,有可能是關鍵字不對或者基因組中沒有這樣的代謝通路功能基因。

一般現在的科技服務公司如果做了kegg pathway資料庫註釋的話,都會做代謝通路圖的註釋,可以從結果檔案中的代謝通路圖查詢,找到想要的代謝通路圖後,再分析哪些基因在基因組上存在。

轉錄組分析怎樣尋找代謝通路基因

如何查詢兩個基因是否在訊號通路間存在聯絡

4樓:匿名使用者

代謝通bai路:目du前在通路資料庫zhi(pathway database) 中代謝dao通路是建立得最好的,有大約

內90個參考

容代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或ec號組成的網路。利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有 的代謝通路:

先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的基因。然後合理地安排ec號。最後將基因組中的基因和參照通路中用ec號編號的基因產物 結合起來。

如何查詢兩個基因是否在訊號通路間存在聯絡

代謝通bai路 目du前在通路資料庫zhi pathway database 中代謝dao通路是建立得最好的,有大約 內90個參考 容代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或ec號組成的網路。利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有 的代謝通路 先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的...

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