菌液測序和提質粒再測序有什麼區別

2025-07-16 07:55:23 字數 2724 閱讀 4615

1樓:網友

從本質上看兩者並無大的不同。所謂的菌液測序其實也是菌液中的質粒通過pcr擴增後達到一定的量後就可以和質粒一樣用於測序儀測序了。但兩者在操作上卻有很多不同,畢竟不同的菌株質粒含量不一致,尤其拷貝數較低的菌液,pcr擴增的成功率不高,那測序的成功率也會降低,而且測序的在效長度也較低。

所以除非質粒比較小或拷貝高,可以直接用菌液測序外,一般還是提質粒測序較為穩妥。

為什麼送去測序的片段要通過菌液,而不是直接拿pcr去測序?

2樓:網友

由於測序的儀器敏感度等原因,每家測序的要求不一樣,收費也不一樣。

一般來說,測序的樣本可以是pcr產物,也可以是質粒。樓上說的有一定道理,但不是不能用pcr產物測序的理由。

要求你提供菌液,是因為他們的測序反應體系對質粒的溶液比較敏感,比如對edta,鹽溶液的濃度等,所以乾脆他們自己來提質粒。pcr產物也類似。他們不清楚你是如何做pcr的,也就不知道反應物當中有沒有會抑制測序的成分。

3樓:隙痕零落

1)pcr產物可能有多條帶(錯配產生,但大小一樣),將其匯入大腸桿菌後,產生的單轉殖一般只接受乙個目的條帶,通過重複,就可以在一定程度上排除錯配造成的誤差。且大腸桿菌複製的錯配率遠遠低於pcr過程中的錯配。

2)測序反應一開始時不穩定,講目的條帶匯入載體中,由於載體的序列保守且已知,一開始的測序反應從載體的序列開始測可以保證目的條帶測序的相對準確性。

酵母菌是不是可以直接測序,不用提質粒

4樓:匿名使用者

你們是自己測序,還是送公司測序?如果是送公司的話,可以直接測序,測序引物為m13通用引物。但是測序之前需要把挑出來的轉殖,擴繁、pcr檢測後再測序。

測序公司再提取質粒-測序。如果是自己測序,酶切應該是檢測用,陽性的質粒再測序。總之,一般情況下,測序都是用質粒。

酶切或者pcr只是用來檢測陽性轉殖,酶切更準確。現在pcr產物也可以直接用來測序。

【求助/交流】質粒濃度只有65ng/ul 能用來測序嗎

5樓:網友

估計有點懸……可以試一試,一定得多送幾個平行樣susizheng(站內聯絡ta)濃度已經可以了。

額,我們自配溶液提質粒基本不用測濃度,都是直接送測序,或者你怕不行直接送菌液也行啊。 我是做完菌液pcr,正確以後提了質粒,酶切也正確,條帶也清晰,但不知怎麼回事測的濃度很低,擔心影響測序。你們不測濃度 怎麼保證你們的質粒沒問題呢郝釗(站內聯絡ta)我一直以為測序首先要pcr擴增,然後測序,難道是拿到質粒直接就可以測?

zgb1982(站內聯絡ta)哦!忘記說了,我們是先菌落(如果太小就再畫線)pcr,挑有條帶的搖菌液,提質粒30ul,2ul酶切驗證。剩下給公司測序,自己也可以留點,不過還有菌落在。

yhmew(站內聯絡ta)測序的話50ng/vl就夠了,一般上反應要150ng,體系是可以調整的。送菌液也是可以的,會先幫你提質粒,然後測序。:)yucheng9255(站內聯絡ta)originally posted by yhmew at 2011-04-01 10:

上反應跟測序有區別嗎? 我是送到takara 不收菌液 測序就是用引物和模版反應啊,和pcr差不多的,可因根據你的樣品調整你的反應,乙個反應150ng就夠了,只是濃度低的話,體系要擴大,影響反應結果。不過只要》50ng/vl一般都是沒有問題的。

我有個質粒已經測序了,但保種的菌液沒長起來。所以用質粒做了轉化,重新挑斑還需要測序嗎?

6樓:匡雅霜

如果是普通的質粒的話,沒有關係,你抽個質粒跑個膠,看看大小對不對就行了。

如果你的質粒上有重複序列,那你要保證你的菌的基因型可以保持這個質粒的穩定。不然質粒會丟失或者改變。

如果你的質粒上有同源序列,那你的菌得是重組酶缺陷的,不然結果同上一條。

dna測序是單向測序,和測通的區別是什麼?

7樓:網友

dna測序bai是單向測序,和測通的區du別dna測序一zhi個反映。

大約dao可以測800bp左右,如果所測目專的序列在屬800bp左右,則乙個反映就可以測通,即完成測序;

如果序列大於800bp,如1500bp,則需要兩個反應才可以完成測序,兩個反應的測序中間是有相同的部分,故需要拼接。

如果是pcr,那麼由於測序原理的原因,引物後面的一段序列是讀不出來的,這樣的話,你做單向測序,那麼最開始的引物後面那一段序列是沒有的,這時候就需要從另一端進行測序,那麼就是選擇測通就可以了。

細菌已經通過搖床搖起,送測序為什麼說提取質粒失敗,要從新搖菌呢

8樓:匿名使用者

因為你用的是表達用的菌株,這裡的質粒的拷貝數都不高,所以你可以把質粒自己提取出來,洗脫的時候少加點洗脫液,拿質粒去測序。還可以把這個質粒轉到dh5a中,送去測序。

9樓:憑衣裝著

搖菌後你觀察濃度沒有,是否達到測序需要的濃度;

你的菌種是大腸桿菌嗎;

你的菌種質粒拷貝數低;

提質粒時失敗。

10樓:防黴抗菌專家

自己還留有樣嗎?可以自己提取一下,看看是不是細菌真的有問題還是測序那邊操作有問題的同時,可以重新再搖菌。

11樓:朝著江河走

可能是搖菌時間太長,或者收集菌體後沒有及時冷藏,導致dna降解,從而質粒提取失敗。

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