1樓:南京金益柏
鏈黴菌為放線菌,屬於細菌的一種,用細菌基因組提取試劑盒應該沒問題,另外,ctab法的植物基因組試劑盒應該也可以的。
基因合成試劑盒是什麼?包括哪些成分?
2樓:網友
所謂基因表達,就是從dna到mrna再到蛋白的乙個過程,基因表達水平一般是通過該基因轉錄的mrna的多少來衡量的。每個基因轉錄產生的mrna的量,是受到時空等多種因素調控的,個體在不同的生長發育階段,或者不同的組織水平,基因轉錄出mrna的量都是不一樣的。例如,當某種植物長期生長在高鹽的環境裡,該植物體內與抗鹽相關的基因的表達量就會增加,以適應這種高鹽環境,是植物能夠生存下來,這時植物抗鹽相關的基因表達水平就相對高,希望我的回答能夠幫你弄清這個問題,呵呵!
鏈黴菌 基因組dna 需要溶菌酶嗎
3樓:匿名使用者
樣品材料老化或者反覆凍融導致dna含量下降:應選擇新鮮的材料樣品,如新鮮血液、新鮮菌液、剛離體的動物組織或幼嫩的植物組織等,不能立即處理的樣品應放入液氮或-70℃低溫儲存,以免dna 降解。
2) 樣品破壁或者裂解不完全,dna 未充分釋放:動植物樣品應在液氮中充分研磨,g+細菌、酵母等破壁較困難的樣品應用溶菌酶、lyticase酶或機械方法協助破壁。
3) 樣品過多導致細胞裂解不充分:加樣過多導致細胞裂解不充分,細胞裂解不充分。
4) dna 吸附不均勻:如在上吸附柱前沒有加無水乙醇,或使用低濃度乙醇代替無水乙醇,會導致dna 不能充分沉澱,與矽膠模吸附不徹底,因此應在樣品裂解後加適量的無水乙醇,再上吸附柱使dna 與矽膠模充分吸附。
5) dna 洗脫不適當:洗脫緩衝液ph 過低會阻礙dna從矽膠模上洗脫下來,應確保洗脫液ph值在之間。洗脫液體積過少(<30μl),不易浸透矽膠模,使dna不能洗脫下來,因此洗脫液體積應大於30μl,超過200μl,所得的dna 濃度降低。
洗脫時可以將洗脫液於65-70℃水浴預熱,加入洗脫液後在室溫靜置2-5分鐘,可提高洗脫效率,加大dna 產量。
基因組測序 都怎麼提基因組,用什麼試劑盒啊
4樓:網友
是沖人的血液中提取全基因組嗎?要是新鮮血液的話用tiangen的試劑盒還可以的,要提陳血用invitrogen效果還可以。
5樓:0o深海的魚
全基因組測序嗎?什麼物種的啊?微生物嗎?
很多試劑盒都可以,invitrogen的盒子好用,不用試劑盒,用傳統的苯酚法也挺好的,做完了可以用柱子純化一下。
6樓:試劑與耗材
方法很多的,北京德元國際科技****可以提供技術服務,提取,檢測,當然,也有試劑盒。
從鏈黴菌中分離某種基因的方法 步驟
7樓:法師藥材店
首先你要知道這個基因的背景,如果這是個已知的基因,那麼你需要調去這個基因的全編碼序列,然後根據這個編碼序列設計pcr引物,上游引物中應含有完整開放可讀框的啟動子,下游引物因含有完整開放可讀框的終止子。接著,你需要提取鏈黴菌的基因組dna,接著用基因組dna作為模板,用之前設計的引物進行pcr擴增。當然,如果你這是個未知的基因,那麼你需要純化獲得目標基因的蛋白質產物,然後進行蛋白質的肽鏈測序,n端測十個左右氨基酸殘基,c端測十個左右氨基酸殘基,然後去查相應的密碼子編碼表,接著設計不同的引物,再利用基因組dna作為模板去擴增。
這個方法其實現在已經基本不用了,現在的基因序列資料庫是很強大的。而且鏈黴菌也已經完成了基因組測序,一般直接在ncbi上blast就能拿到目標基因的序列了,所以第一種方法就ok。
什麼是密碼子的偏愛性?在外源基因表達中有什麼應用
8樓:網友
生物體對密碼子的偏愛性:
不同的生物,甚至同種生物不同的蛋白編碼基因,對於同一氨基酸所對應的簡併密碼子,使用頻率並不相同,也就是說生物體基因對簡併密碼子的選擇具有一定的偏愛性。決定這種偏愛性的因素有三:
a. 生物基因組中的鹼基含量。
在富含at的生物(如單鏈dna噬菌體fx174)基因組中,密碼子第三位上的u和a出現的頻率較高,而在gc豐富的生物(如鏈黴菌)基因組中,第三位上含有g或c的簡併密碼子佔90%以上的絕對優勢。
b. 密碼子與反密碼子相互作用的自由能適中的作用強度最有利於蛋白質生物合成的迅速進行;弱配對作用可能使氨醯基trna分子進入核糖體a位需要總費更多的時間;而強配對作用則可能使轉肽後核糖體在p位逐出空載trna分子耗費更多的時間。
如ggg、ccc、gcg、ggc、aaa、uuu、aua、uau等使用少;
如gug、cac、ucg、agc、aca、ugu、auc、uug等使用多;
c. 細胞內trna的含量。
密碼子偏愛性對外源基因表達的影響。
由於原核生物和真核生物基因組中密碼子的使用頻率具有不同程度的差異性,因此,外源基因尤其是哺乳動物基因在大腸桿菌中高效翻譯的乙個重要因素是密碼子的正確選擇。一般而言,有兩種策略可以使外源基因上的密碼子在大腸桿菌細胞中獲得最佳表達:
a. 外源基因全合成。
b. 同步表達相關trna編碼基因。
2.載體的選擇。
所用表達載體必須是大腸桿菌表達載體,含有大腸桿菌rna聚合酶所能識別的啟動子(如pl、tac、t7等)和sd序列。
1)核糖體結合位點。
外源基因在大腸桿菌細胞中的高效表達不僅取決於轉錄啟動的頻率,而且在很大程度上還與mrna的翻譯起始效率密切相關。大腸桿菌細胞中結構不同的mrna分子具有不同的翻譯效率,它們之間的差別有時可高達數百倍。mrna翻譯的起始效率主要由其5『 端的結構序列所決定,稱為核糖體結合位點(rbs)
2)大腸桿菌核糖體結合位點的特徵。
位於翻譯起始密碼子上游的6-8個核苷酸序列5』 uaaggagg 3』,即shine-dalgarno(sd)序列,它通過識別大腸桿菌核糖體小亞基中的16s rrna 3』端區域3』 auuccucc 5』並與之專一性結合,將mrna定位於核糖體上,從而啟動翻譯;
適合鏈黴菌基因操作的感受態細胞有哪些
9樓:匿名使用者
鏈黴菌屬(streptomyces),其基內菌絲多分枝,一般橫隔稀疏,很少斷裂,常產生各種水溶性或脂溶性的色素;氣生菌絲比基內菌絲稍粗,為外鞘所包,氣生菌絲部分分化成直形、柔曲、鉤環狀至松敞或緊密螺旋形的孢子絲,時常含50個左右的孢子,短者含5~10個孢子;孢子為節孢子,由菌絲斷裂而成,有的脫去外鞘,有的攜帶外鞘或殘餘,外鞘決定孢子的表面結構;dna中的g+c克分子含量為69~76%。
硫鏈絲菌素抗性基因在鏈黴菌中普遍存在嗎
10樓:匿名使用者
(1)質粒是雙鏈環狀dna分子,該dna分子兩條鏈之間是通過氫鍵連線的.(2)據表4和題意,p1j702上原有的乙個bglⅱ位點被目的基因置換後,pzhz8仍可被bglⅱ切為線狀,說明目的基因中必然含有乙個bglⅱ位點.(3)據**中資料可以判斷重組質拉pzhz8
基因組DNA提取中細胞裂解液怎麼配製
氯化鈉和乙醇溶液,根據濃度不同溶解狀況不同。有專門賣的細胞裂解液,需要新增蛋白酶抑制劑。dna提取液分開溶解的原因 摘要。你好,很高興為你服務,為你作出如下解答 dna提取液分開溶解的原因可能是由於提取液中的溶劑 如乙醇 的極性不同,導致提取液分開溶解。解決這個問題的方法是使用混合溶劑,以確保提取液...
基因組DNA製備過程中提取緩衝液有哪些成分,作用是什麼
ste 破壞細胞膜 核膜,分散好的真核生物組織 細胞在含sds和蛋白酶k的溶液中消化分解蛋白質 sds 可使組織蛋白與dna分子分離 edta 能抑制細胞中dnase的活性,使dna分子完整地以可溶形式存在於溶液中 酚 抽提除去蛋白質 氯仿 除去dna溶液中微量酚的汙染 異戊醇 可減少蛋白質變性操作...
dna測序為什麼要測整個基因組,DNA測序為什麼要測整個基因組
在基因組研究領域,人們對資料的可信度有一個基本的要求 單個鹼基越準確越好,對單個鹼基的覆蓋深度越多倍越好,對整個基因組測得越完整越好,測序的 缺口 gap 越少越好。新一代測序中,基因從頭測序和重測序有什麼區別?我要做乙肝病毒dna全長測序,應該選用哪種方法?1 條件不同 從頭測序的條件是不依賴於任...