kegg分析是全部差異表達基因還是上調基因

2021-04-17 22:08:50 字數 675 閱讀 4969

1樓:匿名使用者

代謝通路:目前在通路資料庫(pathway database) 中代謝通路是建立得最好的,有大約90個參考代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或ec號組成的網路。

利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有 的代謝通路:

先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的基因。

然後合理地安排ec號。

最後將基因組中的基因和參照通路中用ec號編號的基因產物 結合起來。

轉錄組測序得資料怎麼判斷kegg富集顯著性

2樓:匿名使用者

轉錄組bai測序得資料怎麼判斷dukegg富集顯著性

提取樣zhi品總rna後,用帶有oligo(dt)的磁dao珠富集真核生版物mrna(若為原核生物,則用權試劑盒去除rrna後進入下一步)。加入fragmentation buffer將mrna打斷成短片段,以mrna為模板,用六鹼基隨機引物(random hexamers)合成第一條cdna鏈,然後加入緩衝液、dntps、rnase h和dna polymerase i合成第二條cdna鏈,在經過qiaquick pcr試劑盒純化並加eb緩衝液洗脫之後做末端修復、加a並連線測序接頭,然後用瓊脂糖凝膠電泳進行片段大小選擇,最後進行pcr擴增,建好的測序文庫用illumina hiseq? 2000進行測序。

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巨集基因組分析就是分析某一環境中所有生物的核酸資訊 全基因組關聯分內析就是測序資料比容對 分析出某種疾病與哪些基因具有相關性分析 比如說gwas分析 外顯子組測序就是通過基因晶片捕獲外顯子區域的序列 或者採用引物擴增的方式捕獲外顯子序列 利用二代測序對靶標外顯子測序並分析 天體生物學是學什麼?天體生...

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將目的基因轉入動物細胞,在基因表達載體構建這一步,用的肯定是質粒。沒有質粒就沒法進行構建。常用的質粒有兩種,一種是真核表達質粒,比如pcdna3.1等,它們有真核啟動子比如cmv,可以進行瞬時轉染。另一種是病毒質粒,比如逆轉錄病毒質粒等,它們可以包裝成逆轉錄病毒,整合到細胞基因組中,穩定地遺傳並表達...

T載體是質粒載體嗎,載體就是基因表達載體嗎

pcr產物一般和 t載體相連,t載體是一種線性載體,和你的目的片段連線以後,就變成了 圓形的質粒。t載體的種類很多,takara的書上有很多介紹。構建重組質粒之前為什麼先連線t載體 先連線t載體是為了提高轉化效率一般來說市面上 的t載體都進行了優化,容易連線片段 也就是效率較高 因此構建表達載體時有...