1樓：匿名使用者
首先進行基因分bai類，比如說du編碼性基因zhi
佔多大比例，非編dao碼性基因又內佔多少比例；轉錄因
2樓：匿名使用者
一般拿bai到序列以後會先做基因
du**，有很多軟體可zhi以做。如果已dao經有官方的基因資料（回official gene set），
答可以與其他物種比較，進行同源分析。
你可以參考這個國外的同源基因資料庫
這個資料庫提供了百來個物種的同源基因分類。你可以直接輸入你感興趣的基因名稱，或者基因序列，然後查詢在其他物種裡的同源基因。而且這個資料庫還提供了基因功能方面的資訊和結構上的資訊，有助於進行進化分析。
一個物種的全基因組測序後，應該怎麼使用生物資訊學方法對其進行研究
3樓：匿名使用者
仿照別人的呀，整體描述測序情況，有趣的功能基因組分析，功能基因驗證
4樓：府高原候麥
借用生物資訊學所涉及的分析方法對基因組進行分析，研究基因的功能、結構、進化等
新一代測序中，基因從頭測序和重測序有什麼區別？我要做乙肝病毒dna全長測序，應該選用哪種方法？
5樓：那年丶人已散盡
1、條件不同
從頭測序的條件是不依賴於任何物種基因組；重測序的條件是在已知物種基因組的情況下進行的。
2、病毒變異率不同
從頭測序是通過拼接和組裝的方式獲得基因組序列圖譜，病毒變異率很低；重測序可以尋找出大量的單核苷酸多型性位點，插入缺失位點，結構變異位點，拷貝數變異等變異資訊，從而獲得生物群體的遺傳特徵。病毒變異率很高。
乙肝病毒在醫學上已經測過，只需要做重測序就可以。
6樓：匿名使用者
從頭測序是目前為止還沒有人測過那個物種的全基因組，沒有參考序列進行比對，需要自己組裝拼接後才能知道序列；而重測序是已經有人測過了，只需要重新測序，有參考序列了，只需要與參考序列比對。
乙肝病毒好像是已經測過的，只需要做重測序就可以！
7樓：美吉生物
基因從頭測序也叫做基因de novo測序，是指不依賴於任何已知基因組序列資訊對某個物種的基因組進行測序，然後應用生物資訊學手段對測序序列進行拼接和組裝，最終獲得該物種基因組序列圖譜。
重測序是指在已知物種基因組的情況下，對物種內的不同個體或某個個體的不同組織進行基因組重測序，可以在全基因組水平上發現不同個體或組織細胞之間的差異。通過這種方法，可以尋找出大量的單核苷酸多型性位點（snp），插入缺失位點（indel，insertion deletion），結構變異位點（sv，structure variation），拷貝數變異（copy number variation，cnv）等變異資訊，從而獲得生物群體的遺傳特徵。
病毒變異率很高，一般不用重測序，可以用de novo從頭測序。
8樓：匿名使用者
專業性東西，自己看看這個
資料
基因組學研究方法
什麼是基因二代測序？
9樓：二凡的kiki妍
第二代測序為高通量測序，採用微珠或高密度晶片邊合成邊測序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次獲得數g資料，相對與第三代，都仍然需要擴增的方法放大訊號，擴增後再檢測。
第一代測序技術的主要特點是測序讀長可達1000bp，準確性高達99.999%，但其測序成本高，通量低等方面的缺點，嚴重影響了其真正大規模的應用。因而第一代測序技術並不是最理想的測序方法。
經過不斷的技術開發和改進，以roche公司的454技術、illumina公司的solexa，hiseq技術和abi公司的solid技術為標記的第二代測序技術誕生了。
第二代測序技術大大降低了測序成本的同時，還大幅提高了測序速度，並且保持了高準確性，以前完成一個人類基因組的測序需要3年時間，而使用二代測序技術則僅僅需要1周，但在序列讀長方面比起第一代測序技術則要短很多。
1）測序文庫的構建（library construction）
首先準備基因組（雖然測序公司要求樣品量要達到200ng，但是gnome analyzer系統所需的樣品量可低至100ng,能應用在很多樣品有限的實驗中），然後將dna隨機片段化成幾百鹼基或更短的小片段，並在兩頭加上特定的接頭（adaptor）。如果是轉錄組測序，則文庫的構建要相對麻煩些，rn**段化之後需反轉成cdna，然後加上接頭，或者先將rna反轉成cdna，然後再片段化並加上接頭。片段的大小（insert size）對於後面的資料分析有影響，可根據需要來選擇。
對於基因組測序來說，通常會選擇幾種不同的insert size，以便在組裝（assembly）的時候獲得更多的資訊。
2）錨定橋接（su***ce attachment and bridge amplification）
solexa測序的反應在叫做flow cell的玻璃管中進行，flow cell又被細分成8個lane，每個lane的內表面有無數的被固定的單連結頭。上述步驟得到的帶接頭的dna 片段變性成單鏈後與測序通道上的接頭引物結合形成橋狀結構，以供後續的預擴增使用。
3）預擴增（denaturation and complete amplification）
新增未標記的dntp 和普通taq 酶進行固相橋式pcr 擴增，單鏈橋型待測片段被擴增成為雙鏈橋型片段。通過變性，釋放出互補的單鏈，錨定到附近的固相表面。通過不斷迴圈，將會在flow cell 的固相表面上獲得上百萬條成簇分佈的雙鏈待測片段。
4）單鹼基延伸測序（single base extension and sequencing）
在測序的flow cell中加入四種熒游標記的dntp 、dna聚合酶以及接頭引物進行擴增，在每一個測序簇延伸互補鏈時，每加入一個被熒游標記的dntp就能釋放出相對應的熒光，測序儀通過捕獲熒光訊號，並通過計算機軟體將光訊號轉化為測序峰，從而獲得待測片段的序列資訊。從熒光訊號獲取待測片段的序列資訊的過程叫做base calling，illumina公司base calling所用的軟體是illumina』s genome analyzer sequencing control software and pipeline analysis software。讀長會受到多個引起訊號衰減的因素所影響，如熒游標記的不完全切割。
隨著讀長的增加，錯誤率也會隨之上升。
5）資料分析（data analyzing）
這一步嚴格來講不能算作測序操作流程的一部分，但是隻有通過這一步前面的工作才顯得有意義。測序得到的原始資料是長度只有幾十個鹼基的序列，要通過生物資訊學工具將這些短的序列組裝成長的contigs甚至是整個基因組的框架，或者把這些序列比對到已有的基因組或者相近物種基因組序列上，並進一步分析得到有生物學意義的結果。
10樓：讚的都帥
即第二代dna測序技術。
dna測序(dna sequencing)作為一種重要的實驗技術，在生物學研究中有著廣泛的應用。早在dna雙螺旋結構(watson and crick,1953)被發現後不久就有人報道過dna測序技術，但是當時的操作流程複雜，沒能形成規模。隨後在2023年sanger發明了具有里程碑意義的末端終止測序法，同年a.
m.maxam和w.gilbert發明了化學降解法。
sanger法因為既簡便又快速，並經過後續的不斷改良，成為了迄今為止dna測序的主流。
然而隨著科學的發展，傳統的sanger測序已經不能完全滿足研究的需要，對模式生物進行基因組重測序以及對一些非模式生物的基因組測序，都需要費用更低、通量更高、速度更快的測序技術，第二代測序技術(next-generation sequencing)應運而生。
這三個技術平臺各有優點，454 flx的測序片段比較長，高質量的讀長(read)能達到400bp;solexa測序價效比最高，不僅機器的售價比其他兩種低，而且執行成本也低，在資料量相同的情況下，成本只有454測序的1/10;solid測序的準確度高，原始鹼基資料的準確度大於99.94%，而在15x覆蓋率時的準確度可以達到99.999%，是目前第二代測序技術中準確度最高的。
基因測序是一種新型基因檢測技術，能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列，**罹患多種疾病的可能性，個體的行為特徵及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因，提前預防和**。
基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用，可以說基因測序技術，是下一個改變世界的技術
11樓：匿名使用者
二代測序：將基因組dna打碎成約100-200個鹼基的小片段，在片段的兩個末端加上接頭 ( adapter )。將dn**段變成單鏈後通過接頭與晶片表面的引物鹼基互補而使一端被固定在晶片上。
另外一端隨機和附近的另外一個引物互補，也被固定住，形成橋狀結構。通過30輪擴增反應，每個單分子被擴增大約1000 倍，成為單克隆的dna簇，隨後將dna 簇線性化。在下一步合成反應中，加入改造過的dna聚合酶和帶有4種熒游標記的dntp。
在dna合成時，每一個核苷酸加到引物末端時都會釋放出焦磷酸鹽，激發生物發光蛋白髮出熒光。用鐳射掃描反應板表面，在讀取每條模板序列第一輪反應所聚合上去的核苷酸種類後，將這些熒光基團化學切割，恢復3』端黏性，隨後新增第二個核苷酸。如此重複直到每條模板序列都完全被聚合為雙鏈。
這樣，統計每輪收集到的熒光訊號結果， 就可以得知每個模板dn**段的序列。（中源-協-和-基-因）
12樓：dotaer嘯塵
全基因組重測序（whole genome sequencing)）是利用高通量測序平臺對已知基因組序列物種的不同個體或群體的基因組進行重測序，並在此基礎上對個體或群體進行差異性分析。
針對染色體大規模結構變異引起的遺傳疾病，利用低覆蓋全基因組測序結合高效的計算分析手段即可解決 。同時，利用低覆蓋全基因組測序技術，還可以對大規模人群連鎖、關聯進行研究。極少數遺傳疾病由編碼蛋白質區域以外的小變異造成。
這類變異只能使用高覆蓋度全基因組測序檢測。euler使用改進的建庫技術進行全基因組測序，提高覆蓋度、均一性、轉化速率等重要指標。通過自主研發的資訊分析管線，全面分析可能的遺傳變異。
案例分析
臨床案例---地中海貧血症
收樣要求
● 樣本型別：外周血，血漿，ffpe。
● 抗凝劑：枸櫞酸鈉或edta，不能用肝素。
● 採用常規edta抗凝採血管採集的靜脈血≥6ml，可在4℃下暫時儲存及運轉，應當自離體後8小時內完成血漿分離。
● 採用專用血漿儲存管（如streck管）採集的靜脈血≥6ml，可在室溫下暫時儲存及運轉，應當自離體後72小時內完成血漿分離。
● 分離的血漿樣本≥2ml，直接儲存於-80°c 冰箱，在乾冰冷鏈狀態下暫時儲存及運轉。
水稻基因組計劃的水稻基因組測序，水稻基因組計劃的意義價值
4 憶江南 白居易 水稻基因組計劃的意義價值 任何一個生物的全基因組序列都蘊藏著這一生物的起源 進化 發育 生理等重要資訊。水稻是全球半數以上人口賴以生存的糧食作物，對於人類生活 糧食安全具有至關重要的意義。研究表明，水稻共有12條染色體，它們記錄著與水稻的高產優質 美味香色以及與生長期 抗病抗蟲 ...
全基因組測序後為什麼還用sanger測序
現在全基因組測序bai用du鳥槍法,把所 有dna打碎zhi成短片段,測出所有dao片段的序列再用回超級計算機進行答 拼接。你說的是老方法,先構建大的長片段文庫,這些長片段互相重疊,能涵蓋全部基因組,即所謂的骨架scaffold。然後在對文庫裡每一個克隆進行亞克隆,應該還進行亞亞克隆,得到可以直接測...
人類基因組的測序是怎麼進行的？求測序的方法及步驟
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在dna合成過程中，dna聚合酶能夠使用ddntp 雙脫氧核苷酸 來作為原料，但它的反應會在加入ddntp的時候終止。具體實驗是通過pcr來完成的，但與普通pcr不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的...