基因的共線性分析怎麼做,做進化分析

2021-05-22 17:17:27 字數 466 閱讀 7722

1樓:

簡單一些的,直接去找mcscanx這個軟體,按照軟體說明,使用基因組的蛋白序列進行blastp比對,比完之回後直接作為這

答個軟體的輸入檔案執行分析,這個軟體也提供了一些後續分析手段。

複雜一些,共線性分析通常分成兩大步驟,第一個是尋找同源對應關係,前面說的blastp就是一個方法,還有文獻會在blastp的基礎上,進一步設定計算公式以獲取篩選過的、更可靠的對應關係,找個基因組文章看看,一般都有。第二個步驟是在對應關係基礎上搜尋共線性,也有兩個選擇,一個是精確要求基因順序具有排列上的共線性,另一個是根據基因的順序,將基因分組(數個基因作為一個單元),允許單元內部基因共線性有差異,但在單元間具有共線性,這種就是所謂的「同線性」關係。

軟體很多的,mcscanx及其原型mcscan,還有mcscan的原型,貌似lastz、last等軟甲還可以比較dna水平上的共線性關係,我是覺得mcscanx最簡單,所以就給你推薦了。

這個線性代數怎麼做?是用,這個線性代數怎麼做?是用PAP 相應的對角矩陣麼?

常見考察由a求特徵值,特徵向量。而本題屬於由特徵值,特徵向量求a。分析 a p1,p2,p3 ap1,ap2,ap3 1p1,2p2,3p3 p1,p2,p3 diag 1,2,3 則 a p1,p2,p3 diag 1,2,3 p1,p2,p3 1 解答 已知 p1,p2,p3 已知diag 1,...

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